C.E 73。尤尼乌斯7落下时所造成的冲击波将城市彻底摧毁，人们也纷纷被卷入了其中，同时地球上也留下了深深的伤痕。恐怖和混乱之中，一架机动战士出现在了仿佛是静止的天空之中。与这纯白色的机体“STARGAZER”一同出现的是有着星之世界理想的DSSD机动战士开发组组员赛雷妮·马克古里夫。然而还有另一个人，用冰冷的眼神凝望这被黑烟包围而看不见星星的天空，他是地球联合军Phantom pain所属的Strike Noir的驾驶员——史威恩·卡尔·巴亚。他们的目光还没有交汇，星光还未闪现……
《机动战士高达SEED DESTINY》TV版放映完结的半年后，SUNRISE终于公开了以C.E.为舞台的系列新作。《高达SEED》全新OVA《观星者》顺势而出，本作的时间设定在了《DESTINY》的尤尼乌斯7落下的事件后发生之后，地球联合军特殊部队“Phantom pain”和调整人组织“深宇宙探查开发机构（DSSD）”之间展开了新的激战。
　　《观星者》的监督是在TV系列中负责绘画的西泽晋。机械设定为大河原邦男和ビークラフト，故事的脚本为大家所熟知的森田繁，最受人关注的角色设定不再启用褒贬不一的平井久司，而负责《观星者》人物设定大贯健一是在《SEED》系列动画的作画监督之一，直接负责大量人物的作画，TV系列中的其他各作人员也将成为《观星者》的幕后功臣。